Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6AQ7L8S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUD6AQ7L8S5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
OTUD6AQ7L8S5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
OTUD6AQ7L8S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141 ms