Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF542PQ5EBM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF542PQ5EBM4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF542PQ5EBM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF542PQ5EBM4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF542PQ5EBM4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.2 ms