Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC178Q5BJE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC178Q5BJE1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC178Q5BJE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC178Q5BJE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC178Q5BJE1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms