Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GRIK5Q16478 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GRIK5Q16478 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GRIK5Q16478 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GRIK5Q16478 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIK5Q16478 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GRIK5Q16478 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
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