Protein–RNA interactions for Protein: Q15287

RNPS1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1Q15287 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNPS1Q15287 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNPS1Q15287 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNPS1Q15287 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNPS1Q15287 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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