Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf61Q13536 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf61Q13536 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf61Q13536 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf61Q13536 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf61Q13536 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf61Q13536 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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