Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IRX6P78412 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IRX6P78412 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IRX6P78412 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IRX6P78412 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IRX6P78412 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
IRX6P78412 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IRX6P78412 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IRX6P78412 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IRX6P78412 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IRX6P78412 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IRX6P78412 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IRX6P78412 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IRX6P78412 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IRX6P78412 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
IRX6P78412 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IRX6P78412 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IRX6P78412 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IRX6P78412 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
IRX6P78412 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
IRX6P78412 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IRX6P78412 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IRX6P78412 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
IRX6P78412 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IRX6P78412 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IRX6P78412 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IRX6P78412 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IRX6P78412 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IRX6P78412 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IRX6P78412 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IRX6P78412 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
IRX6P78412 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IRX6P78412 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
IRX6P78412 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
IRX6P78412 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IRX6P78412 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
IRX6P78412 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
IRX6P78412 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IRX6P78412 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IRX6P78412 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IRX6P78412 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IRX6P78412 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IRX6P78412 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IRX6P78412 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IRX6P78412 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IRX6P78412 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IRX6P78412 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IRX6P78412 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IRX6P78412 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IRX6P78412 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IRX6P78412 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IRX6P78412 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
IRX6P78412 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IRX6P78412 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IRX6P78412 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IRX6P78412 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IRX6P78412 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IRX6P78412 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
IRX6P78412 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
IRX6P78412 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IRX6P78412 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IRX6P78412 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
IRX6P78412 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
IRX6P78412 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IRX6P78412 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
IRX6P78412 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IRX6P78412 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IRX6P78412 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
IRX6P78412 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
IRX6P78412 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
IRX6P78412 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IRX6P78412 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
IRX6P78412 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
IRX6P78412 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IRX6P78412 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IRX6P78412 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IRX6P78412 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
IRX6P78412 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
IRX6P78412 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
IRX6P78412 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
IRX6P78412 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
IRX6P78412 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IRX6P78412 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IRX6P78412 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms