Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OXCT1P55809 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OXCT1P55809 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
OXCT1P55809 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
OXCT1P55809 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OXCT1P55809 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms