Protein–RNA interactions for Protein: P27987

ITPKB, Inositol-trisphosphate 3-kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKBP27987 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITPKBP27987 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITPKBP27987 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITPKBP27987 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITPKBP27987 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITPKBP27987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ITPKBP27987 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms