RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342422.3

C20orf24-201, Transcript of Uncharacterized protein C20orf24, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf24, Length 896 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf24-201ENST00000342422 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.16■■■■■ 7.22
C20orf24-201ENST00000342422 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.71■■■■■ 6.19
C20orf24-201ENST00000342422 ABCC9O60706 1549 aa53.05■■■■■ 6.08
C20orf24-201ENST00000342422 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.77■■■■■ 5.72
C20orf24-201ENST00000342422 NACADO15069 1562 aa50.6■■■■■ 5.69
C20orf24-201ENST00000342422 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.4■■■■■ 5.66
C20orf24-201ENST00000342422 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.12■■■■■ 5.61
C20orf24-201ENST00000342422 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
C20orf24-201ENST00000342422 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.76■■■■■ 5.56
C20orf24-201ENST00000342422 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.73■■■■■ 5.55
C20orf24-201ENST00000342422 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.48■■■■■ 5.51
C20orf24-201ENST00000342422 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.35■■■■■ 5.49
C20orf24-201ENST00000342422 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.23■■■■■ 5.47
C20orf24-201ENST00000342422 SCRIBQ14160 1630 aa48.98■■■■■ 5.43
C20orf24-201ENST00000342422 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.65■■■■■ 5.38
C20orf24-201ENST00000342422 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.04■■■■■ 5.28
C20orf24-201ENST00000342422 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.98■■■■■ 5.27
C20orf24-201ENST00000342422 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.7■■■■■ 5.23
C20orf24-201ENST00000342422 SMARCA4P51532 1647 aa46.8■■■■■ 5.08
C20orf24-201ENST00000342422 NCAPD3P42695 1498 aa46.7■■■■■ 5.07
C20orf24-201ENST00000342422 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.66■■■■■ 5.06
C20orf24-201ENST00000342422 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.63■■■■■ 5.06
C20orf24-201ENST00000342422 SMARCA2P51531 1590 aa46.55■■■■■ 5.04
C20orf24-201ENST00000342422 HMGXB3Q12766 1538 aa46.42■■■■■ 5.02
C20orf24-201ENST00000342422 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.39■■■■■ 5.02
C20orf24-201ENST00000342422 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.35■■■■■ 5.01
C20orf24-201ENST00000342422 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
C20orf24-201ENST00000342422 WIZO95785 1651 aa45.88■■■■■ 4.94
C20orf24-201ENST00000342422 NESP48681 1621 aa45.79■■■■■ 4.92
C20orf24-201ENST00000342422 ERCC6Q03468 1493 aa45.69■■■■■ 4.91
C20orf24-201ENST00000342422 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
C20orf24-201ENST00000342422 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.54■■■■■ 4.88
C20orf24-201ENST00000342422 CUX2O14529 1486 aa45.42■■■■■ 4.86
C20orf24-201ENST00000342422 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
C20orf24-201ENST00000342422 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.3■■■■■ 4.84
C20orf24-201ENST00000342422 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.25■■■■■ 4.83
C20orf24-201ENST00000342422 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.21■■■■■ 4.83
C20orf24-201ENST00000342422 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.2■■■■■ 4.83
C20orf24-201ENST00000342422 CFTRP13569 1480 aa44.94■■■■■ 4.78
C20orf24-201ENST00000342422 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.82■■■■■ 4.77
C20orf24-201ENST00000342422 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.79■■■■■ 4.76
C20orf24-201ENST00000342422 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.78■■■■■ 4.76
C20orf24-201ENST00000342422 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.76■■■■■ 4.76
C20orf24-201ENST00000342422 WDR62O43379 1518 aa44.71■■■■■ 4.75
C20orf24-201ENST00000342422 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.66■■■■■ 4.74
C20orf24-201ENST00000342422 PRDM2Q13029 1718 aa44.62■■■■■ 4.73
C20orf24-201ENST00000342422 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.42■■■■■ 4.7
C20orf24-201ENST00000342422 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
C20orf24-201ENST00000342422 TOPBP1Q92547 1522 aa44.04■■■■■ 4.64
C20orf24-201ENST00000342422 ABCC8Q09428 1581 aa43.93■■■■■ 4.62
C20orf24-201ENST00000342422 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.93■■■■■ 4.62
C20orf24-201ENST00000342422 IFT140Q96RY7 1462 aa43.84■■■■■ 4.61
C20orf24-201ENST00000342422 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
C20orf24-201ENST00000342422 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
C20orf24-201ENST00000342422 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
C20orf24-201ENST00000342422 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
C20orf24-201ENST00000342422 CUX1P39880 1505 aa43.54■■■■■ 4.56
C20orf24-201ENST00000342422 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.46■■■■■ 4.55
C20orf24-201ENST00000342422 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.45■■■■■ 4.55
C20orf24-201ENST00000342422 OSCARQ8IYS5 282 aa43.43■■■■■ 4.54
C20orf24-201ENST00000342422 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.542e-7■■■■■ 33.6
C20orf24-201ENST00000342422 SOGA1O94964 1423 aa43.41■■■■■ 4.54
C20orf24-201ENST00000342422 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
C20orf24-201ENST00000342422 WDR97A6NE52 1622 aa43.18■■■■■ 4.5
C20orf24-201ENST00000342422 CHD1O14646 1710 aa43.14■■■■■ 4.5
C20orf24-201ENST00000342422 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.03■■■■■ 4.48
C20orf24-201ENST00000342422 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
C20orf24-201ENST00000342422 TOP2BQ02880 1626 aa43.01■■■■■ 4.48
C20orf24-201ENST00000342422 SYNJ1O43426 1573 aa43■■■■■ 4.47
C20orf24-201ENST00000342422 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43■■■■■ 4.47
C20orf24-201ENST00000342422 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.99■■■■■ 4.47
C20orf24-201ENST00000342422 GRIN2BQ13224 1484 aa42.96■■■■■ 4.47
C20orf24-201ENST00000342422 FBLN2P98095 1184 aa42.94■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 TRIM41Q8WV44 630 aa42.94■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 PBRM1Q86U86 1689 aa42.9■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.9■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.89■■■■■ 4.46
C20orf24-201ENST00000342422 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
C20orf24-201ENST00000342422 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
C20orf24-201ENST00000342422 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.88■■■■■ 4.45
C20orf24-201ENST00000342422 ARHGEF11O15085 1522 aa42.78■■■■■ 4.44
C20orf24-201ENST00000342422 SYNJ2O15056 1496 aa42.74■■■■■ 4.43
C20orf24-201ENST00000342422 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
C20orf24-201ENST00000342422 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.63■■■■■ 4.42
C20orf24-201ENST00000342422 ADAMTS12P58397 1594 aa42.51■■■■■ 4.4
C20orf24-201ENST00000342422 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.46■■■■■ 4.39
C20orf24-201ENST00000342422 ARAP1Q96P48 1450 aa42.43■■■■■ 4.38
C20orf24-201ENST00000342422 GRIN2AQ12879 1464 aa42.43■■■■■ 4.38
C20orf24-201ENST00000342422 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.39■■■■■ 4.38
C20orf24-201ENST00000342422 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.37■■■■■ 4.37
C20orf24-201ENST00000342422 CEP170Q5SW79 1584 aa42.28■■■■■ 4.36
C20orf24-201ENST00000342422 NUP160Q12769 1436 aa42.27■■■■■ 4.36
C20orf24-201ENST00000342422 KIF27Q86VH2 1401 aa42.13■■■■■ 4.34
C20orf24-201ENST00000342422 IGF1RP08069 1367 aa42.08■■■■■ 4.33
C20orf24-201ENST00000342422 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.05■■■■■ 4.32
C20orf24-201ENST00000342422 SHROOM2Q13796 1616 aa42.04■■■■■ 4.32
C20orf24-201ENST00000342422 CUL7Q14999 1698 aa41.97■■■■■ 4.31
C20orf24-201ENST00000342422 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.9■■■■■ 4.3
C20orf24-201ENST00000342422 JPH4Q96JJ6 628 aa41.81■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms