RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577682.5

FAM222B-205, Transcript of family with sequence similarity 222 member B, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene FAM222B, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM222B-205ENST00000577682 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.69■■■■■ 7.15
FAM222B-205ENST00000577682 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.16■■■■■ 6.1
FAM222B-205ENST00000577682 ABCC9O60706 1549 aa52.76■■■■■ 6.04
FAM222B-205ENST00000577682 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.42■■■■■ 5.66
FAM222B-205ENST00000577682 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.34■■■■■ 5.65
FAM222B-205ENST00000577682 NACADO15069 1562 aa50.22■■■■■ 5.63
FAM222B-205ENST00000577682 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.73■■■■■ 5.55
FAM222B-205ENST00000577682 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
FAM222B-205ENST00000577682 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.31■■■■■ 5.48
FAM222B-205ENST00000577682 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.3■■■■■ 5.48
FAM222B-205ENST00000577682 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.05■■■■■ 5.44
FAM222B-205ENST00000577682 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.97■■■■■ 5.43
FAM222B-205ENST00000577682 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.86■■■■■ 5.41
FAM222B-205ENST00000577682 SCRIBQ14160 1630 aa48.58■■■■■ 5.37
FAM222B-205ENST00000577682 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.33■■■■■ 5.33
FAM222B-205ENST00000577682 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
FAM222B-205ENST00000577682 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.59■■■■■ 5.21
FAM222B-205ENST00000577682 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.46■■■■■ 5.19
FAM222B-205ENST00000577682 NCAPD3P42695 1498 aa46.41■■■■■ 5.02
FAM222B-205ENST00000577682 SMARCA4P51532 1647 aa46.37■■■■■ 5.01
FAM222B-205ENST00000577682 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.35■■■■■ 5.01
FAM222B-205ENST00000577682 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
FAM222B-205ENST00000577682 SMARCA2P51531 1590 aa46.23■■■■■ 4.99
FAM222B-205ENST00000577682 HMGXB3Q12766 1538 aa46.05■■■■■ 4.96
FAM222B-205ENST00000577682 MROH2BQ7Z745 1585 aa46■■■■■ 4.95
FAM222B-205ENST00000577682 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
FAM222B-205ENST00000577682 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.91■■■■■ 4.94
FAM222B-205ENST00000577682 ERCC6Q03468 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
FAM222B-205ENST00000577682 NESP48681 1621 aa45.45■■■■■ 4.87
FAM222B-205ENST00000577682 WIZO95785 1651 aa45.41■■■■■ 4.86
FAM222B-205ENST00000577682 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
FAM222B-205ENST00000577682 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.2■■■■■ 4.83
FAM222B-205ENST00000577682 CUX2O14529 1486 aa45.18■■■■■ 4.82
FAM222B-205ENST00000577682 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.07■■■■■ 4.81
FAM222B-205ENST00000577682 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.03■■■■■ 4.8
FAM222B-205ENST00000577682 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
FAM222B-205ENST00000577682 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
FAM222B-205ENST00000577682 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.74■■■■■ 4.75
FAM222B-205ENST00000577682 CFTRP13569 1480 aa44.64■■■■■ 4.74
FAM222B-205ENST00000577682 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.56■■■■■ 4.72
FAM222B-205ENST00000577682 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
FAM222B-205ENST00000577682 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.53■■■■■ 4.72
FAM222B-205ENST00000577682 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.51■■■■■ 4.72
FAM222B-205ENST00000577682 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.47■■■■■ 4.71
FAM222B-205ENST00000577682 WDR62O43379 1518 aa44.37■■■■■ 4.69
FAM222B-205ENST00000577682 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
FAM222B-205ENST00000577682 PRDM2Q13029 1718 aa43.98■■■■■ 4.63
FAM222B-205ENST00000577682 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
FAM222B-205ENST00000577682 TOPBP1Q92547 1522 aa43.73■■■■■ 4.59
FAM222B-205ENST00000577682 ABCC8Q09428 1581 aa43.7■■■■■ 4.59
FAM222B-205ENST00000577682 IFT140Q96RY7 1462 aa43.61■■■■■ 4.57
FAM222B-205ENST00000577682 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.58■■■■■ 4.57
FAM222B-205ENST00000577682 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
FAM222B-205ENST00000577682 OSCARQ8IYS5 282 aa43.35■■■■■ 4.53
FAM222B-205ENST00000577682 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
FAM222B-205ENST00000577682 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
FAM222B-205ENST00000577682 SOGA1O94964 1423 aa43.21■■■■■ 4.51
FAM222B-205ENST00000577682 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.55e-6■■□□□ 14.3
FAM222B-205ENST00000577682 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.18■■■■■ 4.5
FAM222B-205ENST00000577682 CUX1P39880 1505 aa43.17■■■■■ 4.5
FAM222B-205ENST00000577682 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
FAM222B-205ENST00000577682 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.14■■■■■ 4.5
FAM222B-205ENST00000577682 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
FAM222B-205ENST00000577682 TRIM41Q8WV44 630 aa42.91■■■■■ 4.46
FAM222B-205ENST00000577682 FBLN2P98095 1184 aa42.89■■■■■ 4.46
FAM222B-205ENST00000577682 WDR97A6NE52 1622 aa42.82■■■■■ 4.44
FAM222B-205ENST00000577682 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.77■■■■■ 4.44
FAM222B-205ENST00000577682 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.74■■■■■ 4.43
FAM222B-205ENST00000577682 GRIN2BQ13224 1484 aa42.73■■■■■ 4.43
FAM222B-205ENST00000577682 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.69■■■■■ 4.42
FAM222B-205ENST00000577682 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.66■■■■■ 4.42
FAM222B-205ENST00000577682 CHD1O14646 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
FAM222B-205ENST00000577682 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
FAM222B-205ENST00000577682 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
FAM222B-205ENST00000577682 TOP2BQ02880 1626 aa42.61■■■■■ 4.41
FAM222B-205ENST00000577682 SYNJ1O43426 1573 aa42.58■■■■■ 4.41
FAM222B-205ENST00000577682 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.56■■■■■ 4.4
FAM222B-205ENST00000577682 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-205ENST00000577682 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-205ENST00000577682 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.52■■■■■ 4.4
FAM222B-205ENST00000577682 ARHGEF11O15085 1522 aa42.51■■■■■ 4.4
FAM222B-205ENST00000577682 SYNJ2O15056 1496 aa42.49■■■■■ 4.39
FAM222B-205ENST00000577682 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.48■■■■■ 4.39
FAM222B-205ENST00000577682 PBRM1Q86U86 1689 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM222B-205ENST00000577682 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.31■■■■■ 4.36
FAM222B-205ENST00000577682 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.27■■■■■ 4.36
FAM222B-205ENST00000577682 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.16■■■■■ 4.34
FAM222B-205ENST00000577682 GRIN2AQ12879 1464 aa42.16■■■■■ 4.34
FAM222B-205ENST00000577682 ADAMTS12P58397 1594 aa42.14■■■■■ 4.34
FAM222B-205ENST00000577682 ARAP1Q96P48 1450 aa42.14■■■■■ 4.34
FAM222B-205ENST00000577682 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.14■■■■■ 4.34
FAM222B-205ENST00000577682 NUP160Q12769 1436 aa41.99■■■■■ 4.31
FAM222B-205ENST00000577682 KIF27Q86VH2 1401 aa41.94■■■■■ 4.3
FAM222B-205ENST00000577682 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
FAM222B-205ENST00000577682 IGF1RP08069 1367 aa41.85■■■■■ 4.29
FAM222B-205ENST00000577682 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.67■■■■■ 4.26
FAM222B-205ENST00000577682 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
FAM222B-205ENST00000577682 JPH4Q96JJ6 628 aa41.66■■■■■ 4.26
FAM222B-205ENST00000577682 SHROOM2Q13796 1616 aa41.62■■■■■ 4.25
FAM222B-205ENST00000577682 CUL7Q14999 1698 aa41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms