Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF4P23510 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF4P23510 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF4P23510 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF4P23510 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms