Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGFR4P22455 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FGFR4P22455 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FGFR4P22455 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGFR4P22455 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 250 ms