Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF28P17035 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF28P17035 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF28P17035 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF28P17035 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms