Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCK1P16333 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCK1P16333 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCK1P16333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCK1P16333 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCK1P16333 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCK1P16333 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCK1P16333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCK1P16333 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCK1P16333 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCK1P16333 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCK1P16333 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCK1P16333 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCK1P16333 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCK1P16333 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCK1P16333 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCK1P16333 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCK1P16333 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCK1P16333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCK1P16333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK1P16333 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK1P16333 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCK1P16333 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK1P16333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCK1P16333 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCK1P16333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK1P16333 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK1P16333 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK1P16333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK1P16333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCK1P16333 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCK1P16333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCK1P16333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCK1P16333 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK1P16333 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK1P16333 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK1P16333 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCK1P16333 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK1P16333 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCK1P16333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCK1P16333 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCK1P16333 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCK1P16333 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCK1P16333 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCK1P16333 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCK1P16333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NCK1P16333 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCK1P16333 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCK1P16333 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCK1P16333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCK1P16333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCK1P16333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCK1P16333 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCK1P16333 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NCK1P16333 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCK1P16333 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCK1P16333 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCK1P16333 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCK1P16333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCK1P16333 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCK1P16333 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCK1P16333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NCK1P16333 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCK1P16333 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCK1P16333 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCK1P16333 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCK1P16333 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCK1P16333 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCK1P16333 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCK1P16333 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCK1P16333 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCK1P16333 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCK1P16333 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCK1P16333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCK1P16333 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCK1P16333 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCK1P16333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCK1P16333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms