Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSH2P0DML3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSH2P0DML3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSH2P0DML3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSH2P0DML3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSH2P0DML3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSH2P0DML3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSH2P0DML3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSH2P0DML3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CSH2P0DML3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSH2P0DML3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms