Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSL6Q9UKU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACSL6Q9UKU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACSL6Q9UKU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSL6Q9UKU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ACSL6Q9UKU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms