Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGIF2Q9GZN2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TGIF2Q9GZN2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TGIF2Q9GZN2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TGIF2Q9GZN2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TGIF2Q9GZN2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms