Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AVL9Q8NBF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AVL9Q8NBF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AVL9Q8NBF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AVL9Q8NBF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AVL9Q8NBF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms