Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HACE1Q8IYU2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HACE1Q8IYU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HACE1Q8IYU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HACE1Q8IYU2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms