Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC102BQ68D86 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC102BQ68D86 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC102BQ68D86 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC102BQ68D86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC102BQ68D86 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC102BQ68D86 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms