Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGCGQ13326 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SGCGQ13326 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SGCGQ13326 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGCGQ13326 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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