Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SGCGQ13326 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SGCGQ13326 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SGCGQ13326 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SGCGQ13326 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SGCGQ13326 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SGCGQ13326 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SGCGQ13326 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SGCGQ13326 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SGCGQ13326 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SGCGQ13326 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SGCGQ13326 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SGCGQ13326 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SGCGQ13326 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SGCGQ13326 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SGCGQ13326 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SGCGQ13326 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SGCGQ13326 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SGCGQ13326 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SGCGQ13326 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SGCGQ13326 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SGCGQ13326 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SGCGQ13326 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SGCGQ13326 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SGCGQ13326 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGCGQ13326 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SGCGQ13326 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SGCGQ13326 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SGCGQ13326 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SGCGQ13326 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SGCGQ13326 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGCGQ13326 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SGCGQ13326 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SGCGQ13326 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SGCGQ13326 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SGCGQ13326 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SGCGQ13326 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
SGCGQ13326 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SGCGQ13326 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SGCGQ13326 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SGCGQ13326 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SGCGQ13326 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SGCGQ13326 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SGCGQ13326 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SGCGQ13326 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SGCGQ13326 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SGCGQ13326 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGCGQ13326 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SGCGQ13326 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SGCGQ13326 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SGCGQ13326 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SGCGQ13326 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SGCGQ13326 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SGCGQ13326 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SGCGQ13326 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SGCGQ13326 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SGCGQ13326 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SGCGQ13326 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SGCGQ13326 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SGCGQ13326 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SGCGQ13326 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SGCGQ13326 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SGCGQ13326 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SGCGQ13326 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGCGQ13326 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SGCGQ13326 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SGCGQ13326 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SGCGQ13326 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SGCGQ13326 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SGCGQ13326 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SGCGQ13326 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SGCGQ13326 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SGCGQ13326 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SGCGQ13326 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SGCGQ13326 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SGCGQ13326 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGCGQ13326 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SGCGQ13326 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SGCGQ13326 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SGCGQ13326 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SGCGQ13326 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SGCGQ13326 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGCGQ13326 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SGCGQ13326 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SGCGQ13326 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SGCGQ13326 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGCGQ13326 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SGCGQ13326 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGCGQ13326 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
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