Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN18P56856 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN18P56856 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN18P56856 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN18P56856 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN18P56856 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms