Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGB7P26010 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ITGB7P26010 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB7P26010 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB7P26010 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB7P26010 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB7P26010 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB7P26010 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB7P26010 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms