Protein–RNA interactions for Protein: P07602

PSAP, Prosaposin, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSAPP07602 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PSAPP07602 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PSAPP07602 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PSAPP07602 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PSAPP07602 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSAPP07602 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PSAPP07602 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PSAPP07602 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSAPP07602 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSAPP07602 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSAPP07602 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PSAPP07602 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PSAPP07602 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PSAPP07602 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PSAPP07602 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PSAPP07602 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSAPP07602 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PSAPP07602 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSAPP07602 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSAPP07602 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PSAPP07602 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSAPP07602 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSAPP07602 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSAPP07602 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSAPP07602 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSAPP07602 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSAPP07602 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSAPP07602 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSAPP07602 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSAPP07602 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSAPP07602 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSAPP07602 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSAPP07602 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PSAPP07602 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSAPP07602 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSAPP07602 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSAPP07602 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSAPP07602 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSAPP07602 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSAPP07602 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSAPP07602 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSAPP07602 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSAPP07602 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSAPP07602 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSAPP07602 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSAPP07602 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSAPP07602 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSAPP07602 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSAPP07602 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSAPP07602 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSAPP07602 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSAPP07602 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSAPP07602 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSAPP07602 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSAPP07602 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSAPP07602 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSAPP07602 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSAPP07602 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSAPP07602 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSAPP07602 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSAPP07602 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSAPP07602 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSAPP07602 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSAPP07602 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSAPP07602 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSAPP07602 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSAPP07602 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSAPP07602 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms