Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM221AA4D161 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM221AA4D161 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM221AA4D161 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM221AA4D161 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms