Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP20Q9Y2K6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP20Q9Y2K6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP20Q9Y2K6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP20Q9Y2K6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP20Q9Y2K6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP20Q9Y2K6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms