Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PNPLA8Q9NP80 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA8Q9NP80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA8Q9NP80 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA8Q9NP80 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA8Q9NP80 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA8Q9NP80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms