Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRM3Q9NNZ6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRM3Q9NNZ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRM3Q9NNZ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRM3Q9NNZ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRM3Q9NNZ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms