RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.12■■■■□ 3.37
CCSAP-201ENST00000284617 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.67■■■■□ 3.14
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CCSAP-201ENST00000284617 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.87■■■■□ 3.01
CCSAP-201ENST00000284617 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
CCSAP-201ENST00000284617 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.32■■■□□ 2.93
CCSAP-201ENST00000284617 APLP2Q06481 763 aa33.09■■■□□ 2.89
CCSAP-201ENST00000284617 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.67■■■□□ 2.82
CCSAP-201ENST00000284617 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
CCSAP-201ENST00000284617 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
CCSAP-201ENST00000284617 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CCSAP-201ENST00000284617 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM41Q8WV44 630 aa32.19■■■□□ 2.74
CCSAP-201ENST00000284617 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CCSAP-201ENST00000284617 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.88■■■□□ 2.69
CCSAP-201ENST00000284617 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CCSAP-201ENST00000284617 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.64■■■□□ 2.66
CCSAP-201ENST00000284617 NEFLP07196 543 aa31.53■■■□□ 2.64
CCSAP-201ENST00000284617 MYT1Q01538 1121 aa31.41■■■□□ 2.62
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
CCSAP-201ENST00000284617 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
CCSAP-201ENST00000284617 HRCP23327 699 aa31.16■■■□□ 2.58
CCSAP-201ENST00000284617 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CCSAP-201ENST00000284617 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.9■■■□□ 2.54
CCSAP-201ENST00000284617 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.79■■■□□ 2.52
CCSAP-201ENST00000284617 ITGAEP38570 1179 aa30.7■■■□□ 2.5
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CCSAP-201ENST00000284617 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.47■■■□□ 2.47
CCSAP-201ENST00000284617 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CCSAP-201ENST00000284617 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.32■■■□□ 2.44
CCSAP-201ENST00000284617 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
CCSAP-201ENST00000284617 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CCSAP-201ENST00000284617 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CCSAP-201ENST00000284617 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.82■■■□□ 2.36
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM52Q96A61 297 aa29.81■■■□□ 2.36
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CCSAP-201ENST00000284617 NEUROD1Q13562 356 aa29.74■■■□□ 2.35
CCSAP-201ENST00000284617 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.71■■■□□ 2.35
CCSAP-201ENST00000284617 ANP32CO43423 234 aa29.69■■■□□ 2.34
CCSAP-201ENST00000284617 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
CCSAP-201ENST00000284617 ABCC9O60706 1549 aa29.54■■■□□ 2.32
CCSAP-201ENST00000284617 BCANQ96GW7 911 aa29.54■■■□□ 2.32
CCSAP-201ENST00000284617 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CCSAP-201ENST00000284617 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.39■■■□□ 2.3
CCSAP-201ENST00000284617 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CCSAP-201ENST00000284617 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCSAP-201ENST00000284617 FBLN2P98095 1184 aa29.09■■■□□ 2.25
CCSAP-201ENST00000284617 P3H3Q8IVL6 736 aa29.07■■■□□ 2.24
CCSAP-201ENST00000284617 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.02■■■□□ 2.24
CCSAP-201ENST00000284617 NEFMP07197 916 aa29.01■■■□□ 2.23
CCSAP-201ENST00000284617 TONSLQ96HA7 1378 aa28.9■■■□□ 2.22
CCSAP-201ENST00000284617 ARID3CA6NKF2 412 aa28.87■■■□□ 2.21
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP8Q14318 412 aa28.82■■■□□ 2.2
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC24A1O60721 1099 aa28.72■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 BCL11AQ9H165 835 aa28.7■■■□□ 2.19
CCSAP-201ENST00000284617 SCRIBQ14160 1630 aa28.67■■■□□ 2.18
CCSAP-201ENST00000284617 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.6■■■□□ 2.17
CCSAP-201ENST00000284617 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CCSAP-201ENST00000284617 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
CCSAP-201ENST00000284617 TMC1Q8TDI8 760 aa28.49■■■□□ 2.15
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.46■■■□□ 2.15
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CCSAP-201ENST00000284617 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CCSAP-201ENST00000284617 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.4■■■□□ 2.14
CCSAP-201ENST00000284617 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 MRS2Q9HD23 443 aa28.38■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 CLIP1P30622 1438 aa28.35■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 MIER1Q8N108 512 aa28.35■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.34■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.33■■■□□ 2.13
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY4P0CV99 314 aa28.31■■■□□ 2.12
CCSAP-201ENST00000284617 TSPY10P0CW01 314 aa28.31■■■□□ 2.12
CCSAP-201ENST00000284617 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
CCSAP-201ENST00000284617 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CCSAP-201ENST00000284617 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CCSAP-201ENST00000284617 EEA1Q15075 1411 aa28.24■■■□□ 2.11
CCSAP-201ENST00000284617 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.115e-7■□□□□ 10.7
CCSAP-201ENST00000284617 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
CCSAP-201ENST00000284617 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
CCSAP-201ENST00000284617 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.17■■■□□ 2.1
CCSAP-201ENST00000284617 NBR1Q14596 966 aa28.14■■■□□ 2.09
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA3Q08378 1498 aa28.12■■■□□ 2.09
CCSAP-201ENST00000284617 CEP162Q5TB80 1403 aa28.1■■■□□ 2.09
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.09■■■□□ 2.09
CCSAP-201ENST00000284617 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CCSAP-201ENST00000284617 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms