RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355842.7

ADD1-202, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADD1, Length 4,743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-202ENST00000355842 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.23■■■■■ 4.03
ADD1-202ENST00000355842 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.48■■■■□ 3.91
ADD1-202ENST00000355842 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
ADD1-202ENST00000355842 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.96■■■■□ 3.51
ADD1-202ENST00000355842 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.13■■■■□ 3.21
ADD1-202ENST00000355842 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
ADD1-202ENST00000355842 APLP2Q06481 763 aa34.75■■■■□ 3.15
ADD1-202ENST00000355842 TRIM41Q8WV44 630 aa34.62■■■■□ 3.13
ADD1-202ENST00000355842 ABCC9O60706 1549 aa34.56■■■■□ 3.12
ADD1-202ENST00000355842 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
ADD1-202ENST00000355842 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ADD1-202ENST00000355842 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.87■■■■□ 3.01
ADD1-202ENST00000355842 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
ADD1-202ENST00000355842 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
ADD1-202ENST00000355842 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.6■■■□□ 2.97
ADD1-202ENST00000355842 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.56■■■□□ 2.96
ADD1-202ENST00000355842 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.41■■■□□ 2.94
ADD1-202ENST00000355842 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
ADD1-202ENST00000355842 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ADD1-202ENST00000355842 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
ADD1-202ENST00000355842 SCRIBQ14160 1630 aa32.98■■■□□ 2.87
ADD1-202ENST00000355842 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.92■■■□□ 2.86
ADD1-202ENST00000355842 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
ADD1-202ENST00000355842 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
ADD1-202ENST00000355842 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ADD1-202ENST00000355842 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
ADD1-202ENST00000355842 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.71■■■□□ 2.83
ADD1-202ENST00000355842 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
ADD1-202ENST00000355842 NACADO15069 1562 aa32.52■■■□□ 2.8
ADD1-202ENST00000355842 ITGAEP38570 1179 aa32.48■■■□□ 2.79
ADD1-202ENST00000355842 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.47■■■□□ 2.79
ADD1-202ENST00000355842 FBLN2P98095 1184 aa32.25■■■□□ 2.75
ADD1-202ENST00000355842 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.22■■■□□ 2.75
ADD1-202ENST00000355842 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.15■■■□□ 2.74
ADD1-202ENST00000355842 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.73
ADD1-202ENST00000355842 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
ADD1-202ENST00000355842 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
ADD1-202ENST00000355842 HRCP23327 699 aa31.81■■■□□ 2.68
ADD1-202ENST00000355842 P3H3Q8IVL6 736 aa31.76■■■□□ 2.67
ADD1-202ENST00000355842 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
ADD1-202ENST00000355842 TRIM52Q96A61 297 aa31.66■■■□□ 2.66
ADD1-202ENST00000355842 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
ADD1-202ENST00000355842 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ADD1-202ENST00000355842 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.61■■■□□ 2.65
ADD1-202ENST00000355842 NEFLP07196 543 aa31.53■■■□□ 2.64
ADD1-202ENST00000355842 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.64
ADD1-202ENST00000355842 ARID3CA6NKF2 412 aa31.49■■■□□ 2.63
ADD1-202ENST00000355842 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.44■■■□□ 2.62
ADD1-202ENST00000355842 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.43■■■□□ 2.62
ADD1-202ENST00000355842 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.61
ADD1-202ENST00000355842 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
ADD1-202ENST00000355842 EEA1Q15075 1411 aa31.32■■■□□ 2.6
ADD1-202ENST00000355842 NEUROD1Q13562 356 aa31.29■■■□□ 2.6
ADD1-202ENST00000355842 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
ADD1-202ENST00000355842 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
ADD1-202ENST00000355842 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
ADD1-202ENST00000355842 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
ADD1-202ENST00000355842 KIF27Q86VH2 1401 aa31.1■■■□□ 2.57
ADD1-202ENST00000355842 CLIP1P30622 1438 aa31.06■■■□□ 2.56
ADD1-202ENST00000355842 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.05■■■□□ 2.56
ADD1-202ENST00000355842 SMARCA2P51531 1590 aa31.04■■■□□ 2.56
ADD1-202ENST00000355842 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
ADD1-202ENST00000355842 ERCC6Q03468 1493 aa31.04■■■□□ 2.56
ADD1-202ENST00000355842 GOLGA3Q08378 1498 aa31.01■■■□□ 2.55
ADD1-202ENST00000355842 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ADD1-202ENST00000355842 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.94■■■□□ 2.54
ADD1-202ENST00000355842 ERICH6Q7L0X2 663 aa30.91■■■□□ 2.54
ADD1-202ENST00000355842 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
ADD1-202ENST00000355842 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.84■■■□□ 2.53
ADD1-202ENST00000355842 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.82■■■□□ 2.52
ADD1-202ENST00000355842 TSPY4P0CV99 314 aa30.78■■■□□ 2.52
ADD1-202ENST00000355842 TSPY10P0CW01 314 aa30.78■■■□□ 2.52
ADD1-202ENST00000355842 CEP162Q5TB80 1403 aa30.78■■■□□ 2.52
ADD1-202ENST00000355842 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.75■■■□□ 2.51
ADD1-202ENST00000355842 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.74■■■□□ 2.51
ADD1-202ENST00000355842 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.7■■■□□ 2.51
ADD1-202ENST00000355842 BCANQ96GW7 911 aa30.68■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 ANP32CO43423 234 aa30.67■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.67■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 CUX2O14529 1486 aa30.64■■■□□ 2.5
ADD1-202ENST00000355842 TONSLQ96HA7 1378 aa30.62■■■□□ 2.49
ADD1-202ENST00000355842 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.59■■■□□ 2.49
ADD1-202ENST00000355842 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.58■■■□□ 2.49
ADD1-202ENST00000355842 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.54■■■□□ 2.48
ADD1-202ENST00000355842 WIZO95785 1651 aa30.53■■■□□ 2.48
ADD1-202ENST00000355842 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.53■■■□□ 2.48
ADD1-202ENST00000355842 KCNH8Q96L42 1107 aa30.52■■■□□ 2.48
ADD1-202ENST00000355842 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
ADD1-202ENST00000355842 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.472e-9■■■□□ 16.7
ADD1-202ENST00000355842 SMARCA4P51532 1647 aa30.47■■■□□ 2.47
ADD1-202ENST00000355842 SOGA1O94964 1423 aa30.47■■■□□ 2.47
ADD1-202ENST00000355842 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
ADD1-202ENST00000355842 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.38■■■□□ 2.45
ADD1-202ENST00000355842 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
ADD1-202ENST00000355842 ABCC8Q09428 1581 aa30.37■■■□□ 2.45
ADD1-202ENST00000355842 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.31■■■□□ 2.44
ADD1-202ENST00000355842 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
ADD1-202ENST00000355842 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms