RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.56■■■■□ 3.6
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PTPRJ-201ENST00000418331 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.25■■■■□ 3.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 NEFLP07196 543 aa31.54■■■□□ 2.64
PTPRJ-201ENST00000418331 HRCP23327 699 aa31.49■■■□□ 2.63
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PTPRJ-201ENST00000418331 MYT1Q01538 1121 aa30.41■■■□□ 2.46
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PTPRJ-201ENST00000418331 ANP32CO43423 234 aa30.08■■■□□ 2.41
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.92■■■□□ 2.38
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PTPRJ-201ENST00000418331 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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PTPRJ-201ENST00000418331 CLIP1P30622 1438 aa29.35■■■□□ 2.29
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PTPRJ-201ENST00000418331 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.3■■■□□ 2.28
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PTPRJ-201ENST00000418331 BCL11AQ9H165 835 aa29.21■■■□□ 2.27
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PTPRJ-201ENST00000418331 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.93■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.91■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 MRS2Q9HD23 443 aa28.89■■■□□ 2.22
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.88■■■□□ 2.21
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