Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTRA1Q92743 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTRA1Q92743 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTRA1Q92743 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HTRA1Q92743 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HTRA1Q92743 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms