Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP13-2Q52LG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP13-2Q52LG2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRTAP13-2Q52LG2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRTAP13-2Q52LG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms