Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KRTAP13-2Q52LG2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KRTAP13-2Q52LG2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP13-2Q52LG2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KRTAP13-2Q52LG2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP13-2Q52LG2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP13-2Q52LG2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KRTAP13-2Q52LG2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP13-2Q52LG2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRTAP13-2Q52LG2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP13-2Q52LG2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP13-2Q52LG2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRTAP13-2Q52LG2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KRTAP13-2Q52LG2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP13-2Q52LG2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KRTAP13-2Q52LG2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRTAP13-2Q52LG2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KRTAP13-2Q52LG2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KRTAP13-2Q52LG2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KRTAP13-2Q52LG2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KRTAP13-2Q52LG2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRTAP13-2Q52LG2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KRTAP13-2Q52LG2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP13-2Q52LG2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KRTAP13-2Q52LG2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP13-2Q52LG2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KRTAP13-2Q52LG2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP13-2Q52LG2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KRTAP13-2Q52LG2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP13-2Q52LG2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP13-2Q52LG2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRTAP13-2Q52LG2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRTAP13-2Q52LG2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KRTAP13-2Q52LG2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRTAP13-2Q52LG2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRTAP13-2Q52LG2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRTAP13-2Q52LG2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRTAP13-2Q52LG2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KRTAP13-2Q52LG2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KRTAP13-2Q52LG2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KRTAP13-2Q52LG2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRTAP13-2Q52LG2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KRTAP13-2Q52LG2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP13-2Q52LG2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KRTAP13-2Q52LG2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRTAP13-2Q52LG2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KRTAP13-2Q52LG2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KRTAP13-2Q52LG2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KRTAP13-2Q52LG2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP13-2Q52LG2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KRTAP13-2Q52LG2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KRTAP13-2Q52LG2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP13-2Q52LG2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KRTAP13-2Q52LG2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP13-2Q52LG2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRTAP13-2Q52LG2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KRTAP13-2Q52LG2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KRTAP13-2Q52LG2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KRTAP13-2Q52LG2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KRTAP13-2Q52LG2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KRTAP13-2Q52LG2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP13-2Q52LG2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP13-2Q52LG2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP13-2Q52LG2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP13-2Q52LG2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP13-2Q52LG2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP13-2Q52LG2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP13-2Q52LG2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP13-2Q52LG2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP13-2Q52LG2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP13-2Q52LG2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP13-2Q52LG2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP13-2Q52LG2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP13-2Q52LG2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KRTAP13-2Q52LG2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms