Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT16Q17RD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT16Q17RD7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT16Q17RD7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT16Q17RD7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT16Q17RD7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYT16Q17RD7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms