Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SURF6O75683 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SURF6O75683 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SURF6O75683 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SURF6O75683 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SURF6O75683 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SURF6O75683 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SURF6O75683 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SURF6O75683 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SURF6O75683 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SURF6O75683 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SURF6O75683 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SURF6O75683 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SURF6O75683 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SURF6O75683 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SURF6O75683 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SURF6O75683 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SURF6O75683 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SURF6O75683 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SURF6O75683 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SURF6O75683 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SURF6O75683 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SURF6O75683 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SURF6O75683 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SURF6O75683 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SURF6O75683 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SURF6O75683 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SURF6O75683 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SURF6O75683 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SURF6O75683 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SURF6O75683 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SURF6O75683 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
SURF6O75683 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SURF6O75683 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SURF6O75683 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
SURF6O75683 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SURF6O75683 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
SURF6O75683 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SURF6O75683 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SURF6O75683 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SURF6O75683 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SURF6O75683 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SURF6O75683 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SURF6O75683 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SURF6O75683 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SURF6O75683 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SURF6O75683 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SURF6O75683 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SURF6O75683 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SURF6O75683 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SURF6O75683 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SURF6O75683 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SURF6O75683 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SURF6O75683 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SURF6O75683 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SURF6O75683 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SURF6O75683 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SURF6O75683 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SURF6O75683 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SURF6O75683 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SURF6O75683 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SURF6O75683 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SURF6O75683 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SURF6O75683 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SURF6O75683 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SURF6O75683 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SURF6O75683 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SURF6O75683 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SURF6O75683 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SURF6O75683 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SURF6O75683 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SURF6O75683 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SURF6O75683 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SURF6O75683 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SURF6O75683 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SURF6O75683 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SURF6O75683 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SURF6O75683 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms