Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F8VP50 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
F8VP50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
F8VP50 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
F8VP50 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
F8VP50 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F8VP50 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
F8VP50 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
F8VP50 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
F8VP50 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
F8VP50 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F8VP50 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
F8VP50 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
F8VP50 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
F8VP50 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
F8VP50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F8VP50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
F8VP50 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
F8VP50 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
F8VP50 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F8VP50 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F8VP50 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
F8VP50 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
F8VP50 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F8VP50 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F8VP50 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F8VP50 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
F8VP50 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
F8VP50 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F8VP50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F8VP50 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
F8VP50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
F8VP50 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
F8VP50 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
F8VP50 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
F8VP50 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
F8VP50 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
F8VP50 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
F8VP50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F8VP50 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F8VP50 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F8VP50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
F8VP50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
F8VP50 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F8VP50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F8VP50 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F8VP50 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F8VP50 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F8VP50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F8VP50 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F8VP50 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F8VP50 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
F8VP50 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
F8VP50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
F8VP50 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F8VP50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
F8VP50 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
F8VP50 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
F8VP50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
F8VP50 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
F8VP50 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F8VP50 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
F8VP50 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F8VP50 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F8VP50 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F8VP50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F8VP50 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F8VP50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F8VP50 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
F8VP50 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
F8VP50 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
F8VP50 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F8VP50 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
F8VP50 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
F8VP50 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F8VP50 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F8VP50 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
F8VP50 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
F8VP50 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
F8VP50 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
F8VP50 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F8VP50 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
F8VP50 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F8VP50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F8VP50 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F8VP50 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F8VP50 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
F8VP50 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
F8VP50 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
F8VP50 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
F8VP50 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F8VP50 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F8VP50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F8VP50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F8VP50 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
F8VP50 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F8VP50 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F8VP50 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
F8VP50 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F8VP50 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms