Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.34■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
STRCP1A6NGW2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
STRCP1A6NGW2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
STRCP1A6NGW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
STRCP1A6NGW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
STRCP1A6NGW2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
STRCP1A6NGW2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
STRCP1A6NGW2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
STRCP1A6NGW2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms