Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
STRCP1A6NGW2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.37■■■■■ 5.49
STRCP1A6NGW2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.26■■■■■ 5.48
STRCP1A6NGW2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
STRCP1A6NGW2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
STRCP1A6NGW2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
STRCP1A6NGW2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
STRCP1A6NGW2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
STRCP1A6NGW2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
STRCP1A6NGW2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
STRCP1A6NGW2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
STRCP1A6NGW2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC47.12■■■■■ 5.13
STRCP1A6NGW2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.93■■■■■ 5.1
STRCP1A6NGW2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
STRCP1A6NGW2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
STRCP1A6NGW2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
STRCP1A6NGW2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC46.58■■■■■ 5.05
STRCP1A6NGW2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
STRCP1A6NGW2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
STRCP1A6NGW2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
STRCP1A6NGW2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
STRCP1A6NGW2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
STRCP1A6NGW2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.89■■■■■ 4.94
STRCP1A6NGW2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
STRCP1A6NGW2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.91
STRCP1A6NGW2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
STRCP1A6NGW2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
STRCP1A6NGW2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.64■■■■■ 4.9
STRCP1A6NGW2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
STRCP1A6NGW2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
STRCP1A6NGW2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
STRCP1A6NGW2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
STRCP1A6NGW2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
STRCP1A6NGW2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
STRCP1A6NGW2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
STRCP1A6NGW2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
STRCP1A6NGW2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
STRCP1A6NGW2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
STRCP1A6NGW2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
STRCP1A6NGW2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
STRCP1A6NGW2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
STRCP1A6NGW2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
STRCP1A6NGW2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
STRCP1A6NGW2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
STRCP1A6NGW2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
STRCP1A6NGW2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
STRCP1A6NGW2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
STRCP1A6NGW2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
STRCP1A6NGW2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
STRCP1A6NGW2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
STRCP1A6NGW2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
STRCP1A6NGW2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
STRCP1A6NGW2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
STRCP1A6NGW2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
STRCP1A6NGW2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
STRCP1A6NGW2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
STRCP1A6NGW2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
STRCP1A6NGW2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
STRCP1A6NGW2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
STRCP1A6NGW2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
STRCP1A6NGW2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
STRCP1A6NGW2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
STRCP1A6NGW2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.65■■■■■ 4.58
STRCP1A6NGW2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
STRCP1A6NGW2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
STRCP1A6NGW2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
STRCP1A6NGW2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
STRCP1A6NGW2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
STRCP1A6NGW2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
STRCP1A6NGW2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
STRCP1A6NGW2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
STRCP1A6NGW2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
STRCP1A6NGW2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
STRCP1A6NGW2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
STRCP1A6NGW2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
STRCP1A6NGW2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
STRCP1A6NGW2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
STRCP1A6NGW2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
STRCP1A6NGW2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
STRCP1A6NGW2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
STRCP1A6NGW2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
STRCP1A6NGW2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
STRCP1A6NGW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
STRCP1A6NGW2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
STRCP1A6NGW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
STRCP1A6NGW2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
STRCP1A6NGW2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
STRCP1A6NGW2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
STRCP1A6NGW2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
STRCP1A6NGW2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
STRCP1A6NGW2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.67■■■■■ 4.42
STRCP1A6NGW2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
STRCP1A6NGW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms