Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EPB41L3Q9Y2J2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EPB41L3Q9Y2J2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EPB41L3Q9Y2J2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EPB41L3Q9Y2J2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EPB41L3Q9Y2J2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms