Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LPAR3Q9UBY5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR3Q9UBY5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR3Q9UBY5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR3Q9UBY5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPAR3Q9UBY5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1327.4 ms