Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC8

IFT46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT46Q9NQC8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT46Q9NQC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT46Q9NQC8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT46Q9NQC8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFT46Q9NQC8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT46Q9NQC8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms