Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NDEL1Q9GZM8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDEL1Q9GZM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDEL1Q9GZM8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDEL1Q9GZM8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDEL1Q9GZM8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDEL1Q9GZM8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms