Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQC3

DPH2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPH2Q9BQC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DPH2Q9BQC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DPH2Q9BQC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DPH2Q9BQC3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DPH2Q9BQC3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DPH2Q9BQC3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms