Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCFD1Q8WVM8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCFD1Q8WVM8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCFD1Q8WVM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCFD1Q8WVM8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCFD1Q8WVM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCFD1Q8WVM8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms