Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNPLA1Q8N8W4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNPLA1Q8N8W4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PNPLA1Q8N8W4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA1Q8N8W4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PNPLA1Q8N8W4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PNPLA1Q8N8W4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms