Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF39Q86UA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF39Q86UA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF39Q86UA1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF39Q86UA1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF39Q86UA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF39Q86UA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms