Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3EQ6PEY2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3EQ6PEY2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3EQ6PEY2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBA3EQ6PEY2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA3EQ6PEY2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3EQ6PEY2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms